Thoát nước và xử lý nước thải đang là vấn đề bức bách, ảnh hưởng đến chất lượng môi trường sống và phát triển bền vững của đô thị. Thành phố Huế đã có những đầu tư cho lĩnh vực này, song tỷ lệ thoát nước và xử lý nước thải sinh hoạt ở khu vực đô thị mới đạt khoảng 65%.