Trụ sở quận Phú Xuân được đặt tại tại trụ sở Bộ Chỉ huy Quân sự tỉnh (cũ), (đường Mang Cá lớn, phường Thuận Lộc, thành phố Huế); trụ sở Công an quận Phú Xuân đặt tại khối nhà H và khối nhà F tại Khu chung cư Hương Sơ (TP. Huế).